การก่อตั้งมูลนิธิโรคกระดูกพรุนแห่งประเทศไทยฯ เกิดขึ้นจากการร่วมมือกันของแพทย์สาขาต่างๆ เป็นกรรมการจัดการประชุมวิชาการโรคกระดูกพรุนแห่งกลุ่มประเทศเอเชีย ครั้งที่ 1 โดยเป็นการจัดการประชุมระหว่างราชวิทยาลัยแพทย์ออร์โธปิดิกส์ แห่งประเทศไทยร่วมกับ International Osteoporosis Foundation (IOF) โดยทางราชวิทยาลัยแพทย์ออร์โธปิดิกส์ฯ ได้แต่งตั้งให้นายแพทย์สุทร บวรรัตนเวช เป็นประธานจัดการประชุมวิชาการดังกล่าว ซึ่งนพ.สุนทร ได้ทำหนังสือเรียนเชิญอาจารย์ผู้ใหญ่ในสาขาต่างๆ ที่เกี่ยวข้องอาทิเช่น สาขาออร์โธปิดิกส์ สาขาอายุรศาสตร์ สาขาเวชศาสตร์ฟื้นฟู และสาขาสูตินรีเวชศาสตร์ มาร่วมเป็นกรรมการ

ในระหว่างดำเนินงาน ทางคณะกรรมการฯ ได้เล็งเห็นว่าปัญหาโรคกระดูกพรุน กำลังจะเป็นปัญหาสาธารณสุขระดับชาติในอนาคต ถ้าหากไม่ได้มีการร่วมมือจากแพทย์ทุกสาขาที่เกี่ยวข้องในการรณรงค์ให้ประชาชนมีความรู้ความเข้าใจ ตลอดจนแพทย์ซึ่งอยู่ในแต่ละสาขาที่เกี่ยวข้อง จำเป็นจะต้องได้รับการศึกษาเกี่ยวกับโรคกระดูกพรุนที่ถูกต้อง นอกจากนี้ยังไม่มีองค์กรกลางของประเทศไทยที่จะรวบรวมแพทย์ทุกสาขาที่เกี่ยวข้องเพื่อมาทำงานร่วมกันในระดับชาติและเป็นองค์กรกลางในการติดต่อกับนานาประเทศ จึงได้มีความคิดริเริ่มที่จะก่อตั้งมูลนิธิโรคกระดูกพรุนแห่งประเทศไทยขึ้นมาโดยมีวัตถุประสงค์ดังกล่าว